73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6947 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 161 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  90.68 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  74.53 
 
 		 162 aa  191  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.29 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.29 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.29 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  54.14 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  55.35 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.05 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  55.41 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  56.05 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.57 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.14 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  53.5 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  43.67 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50.32 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  44.3 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.4 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.95 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  39.1 
 
 		 161 aa  97.1  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  42.21 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  42.31 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  40.91 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.97 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  42 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  40.65 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  40.65 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  41.29 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.41 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  45.3 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  38.22 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  46.94 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.4 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.82 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.8 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.99 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.89 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.4 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.07 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.72 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.54 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  24.69 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.63 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  24.53 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.98 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.48 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  24.68 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.5 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  27.46 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  23.81 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  28.92 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  24.54 
 
 		 175 aa  42  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.68 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.08 
 
 		 207 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.68 
 
 		 208 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.77 
 
 		 207 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  25.83 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.5 
 
 		 205 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  27.66 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  41.46 
 
 		 321 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>