96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2591 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 185 aa  354  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  63.95 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  62.79 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  63.64 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  55.23 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  55.91 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  57.84 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  43.23 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  43.23 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.21 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  41.94 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  41.94 
 
 		 159 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.75 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  35.48 
 
 		 161 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.67 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 		 159 aa  92.4  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  38.71 
 
 		 161 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.38 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.51 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.88 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  35.88 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  38.06 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  36.88 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.46 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.52 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  37.09 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.88 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.18 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.82 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.79 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.42 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.31 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.62 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.31 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  33.52 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.34 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.65 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.9 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.91 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.95 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.59 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.39 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28.95 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.26 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.33 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.68 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.41 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.01 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.81 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.76 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.33 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  25.42 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  25.64 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.95 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  20.71 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.35 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  31.11 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  27.67 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  31.01 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.84 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.67 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6066  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.19 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.86 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  25.88 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  29.85 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.56 
 
 		 207 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  32.18 
 
 		 199 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  26.99 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  25.79 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 175 aa  42  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.79 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.79 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  24.29 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  22.62 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  32.68 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.4 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>