66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2333 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  32.41 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  32.51 
 
 
248 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  23.72 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  25.54 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  25.32 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  24.11 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  26.2 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.14 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.78 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  24.46 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  22.78 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.12 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.74 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.48 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  25.95 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.07 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
163 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.31 
 
 
162 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  23.56 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
163 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.46 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.57 
 
 
183 aa  52.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  42 
 
 
175 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  22.13 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.18 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  30.3 
 
 
141 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  29.89 
 
 
164 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.35 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  22.75 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.42 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
164 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.4 
 
 
141 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.93 
 
 
141 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  22.67 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.59 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  30.82 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  30.82 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 
175 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  25.16 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.22 
 
 
181 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  25.32 
 
 
175 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
175 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  24.71 
 
 
164 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.33 
 
 
167 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.17 
 
 
139 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.56 
 
 
164 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.91 
 
 
179 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
181 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  32.56 
 
 
163 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
179 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  23.08 
 
 
146 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 
197 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.49 
 
 
176 aa  42.7  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.84 
 
 
185 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
156 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
161 aa  42  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>