109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0843 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  100 
 
 
163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  74.53 
 
 
164 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  76.07 
 
 
163 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  74.23 
 
 
163 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  73.62 
 
 
163 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  72.67 
 
 
161 aa  177  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  73.29 
 
 
161 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.99 
 
 
163 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.55 
 
 
162 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.8 
 
 
162 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.55 
 
 
162 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.72 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  44.3 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  44.94 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  43.04 
 
 
159 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.46 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  42.41 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  41.77 
 
 
159 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.67 
 
 
161 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  37.01 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  54.37 
 
 
162 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  44.94 
 
 
161 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.9 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  53.85 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.99 
 
 
182 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  41.72 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.8 
 
 
183 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  44.37 
 
 
163 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  38.12 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.02 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  36.88 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  42.5 
 
 
184 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  42.75 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  40 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  40.83 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.68 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.17 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  39.17 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.11 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.71 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.93 
 
 
203 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.47 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.19 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.07 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.07 
 
 
208 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.9 
 
 
205 aa  50.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.29 
 
 
203 aa  50.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.32 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  36 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.21 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  24.39 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.09 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.73 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 
175 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.73 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.37 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.88 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.14 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.46 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.46 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
164 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.25 
 
 
172 aa  44.7  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  28.38 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3385  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000169967  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.8 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.62 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  25.85 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  29.2 
 
 
1359 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.77 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 
181 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.84 
 
 
192 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  33.54 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  24.66 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.34 
 
 
189 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  33.09 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  36.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  27.03 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  36.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  36.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  36.19 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
179 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  27.45 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>