114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0394 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 
173 aa  324  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.04 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.37 
 
 
182 aa  89  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.42 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.71 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.62 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  35.26 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  35.26 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  31.87 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  37.16 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.4 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.6 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.06 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
174 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  37.18 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.1 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  37.59 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.46 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
179 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  38.18 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.73 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.97 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  34.84 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.89 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  30.32 
 
 
194 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  33.14 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.77 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.61 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.51 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 
206 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2201  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
177 aa  51.6  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.357638  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  21.33 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 
187 aa  51.2  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.32 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
200 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
181 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  35.33 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  40.54 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.44 
 
 
161 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 
238 aa  48.5  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  50 
 
 
162 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  32.33 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  25.81 
 
 
165 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.99 
 
 
207 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.41 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.41 
 
 
208 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.97 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.53 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  20.92 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  20.92 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.97 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  23.53 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  22.01 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.76 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.33 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.86 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.37 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  29.59 
 
 
180 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30.41 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  34.75 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.95 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.57 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.25 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  25.48 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  22.38 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2718  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 
203 aa  41.6  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>