259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3676 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
189 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.21 
 
 
204 aa  87.8  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.48 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.42 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  34.03 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.74 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.74 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.49 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.48 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.9 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.21 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.48 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.47 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.55 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.9 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.14 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.85 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.57 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.49 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.49 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.76 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.68 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  32.72 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.24 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.52 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.2 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.99 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.87 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.93 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  27.16 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  31.87 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  31.16 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  30.81 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.73 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.51 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.96 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.94 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  34.39 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.13 
 
 
161 aa  62.8  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.71 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  24.49 
 
 
162 aa  61.6  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
179 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 
159 aa  61.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.97 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.44 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.63 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.15 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 
165 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.59 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  31.82 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.92 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.11 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.11 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.62 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.8 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  31.17 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
161 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  26.95 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  28.92 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.35 
 
 
168 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.11 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>