85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0449 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.19 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.19 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.39 
 
 		 205 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  69.54 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  70.69 
 
 		 207 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  58 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  62.11 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  47.8 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.98 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.37 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.78 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.09 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.75 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.4 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.75 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.47 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.31 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.35 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.44 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.63 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.89 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.69 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.86 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.25 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.44 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  40.11 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.1 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.68 
 
 		 189 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.48 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.09 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.48 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.58 
 
 		 180 aa  85.1  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.49 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.43 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.73 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.82 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.56 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.92 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.78 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.05 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  30.11 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  22.15 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.36 
 
 		 164 aa  52  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  31.58 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.21 
 
 		 162 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.6 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.26 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  32.22 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.33 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  34.19 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.09 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.48 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.85 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  26.98 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  22.3 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  31.46 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  24.46 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.48 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.54 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  35 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.14 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.41 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.48 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.28 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.17 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 161 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.48 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  28.23 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  28.23 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  26.74 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.01 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.6 
 
 		 138 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  26.87 
 
 		 159 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  30.58 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>