56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1078 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 166 aa  311  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  58.54 
 
 		 163 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1318  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.69 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.49 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.59 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.26 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.84 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.84 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.13 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.26 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.99 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.49 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.59 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.76 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.59 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.03 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.82 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.82 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.14 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.04 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.71 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.57 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.87 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.23 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.55 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  33.99 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.69 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.83 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.83 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.5 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.17 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.09 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.81 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  37.42 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.03 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.65 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.64 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.78 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.86 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  30.12 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.48 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.87 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  21.6 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  21.89 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  22.15 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  23.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  29.08 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  31.06 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.01 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  27.54 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>