61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1036 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 180 aa  347  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  95.56 
 
 		 180 aa  284  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  77.08 
 
 		 181 aa  210  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  72.35 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.54 
 
 		 193 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  60.87 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.22 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.04 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.23 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.55 
 
 		 185 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.87 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.08 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.08 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.2 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.34 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.06 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.82 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.73 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.4 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  41.98 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.17 
 
 		 161 aa  88.2  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.66 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.76 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.06 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.06 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.19 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.62 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.06 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.24 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.62 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.35 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.69 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.94 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  33.52 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.59 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.49 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.23 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.62 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  34.19 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.84 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  29.07 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  34.31 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.57 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  32.71 
 
 		 1359 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  38.89 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  25.98 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.3 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  29.57 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.4 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  35.16 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.24 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  32.34 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  35.06 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.37 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  41.84 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2621  ATP synthase F0, B subunit  32.34 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  35.58 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.05 
 
 		 175 aa  40.8  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>