88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3820 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3820  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  59.35 
 
 		 187 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.33 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.78 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3173  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.9 
 
 		 201 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.420032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3497  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.9 
 
 		 201 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.45 
 
 		 208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.45 
 
 		 208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.45 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0912  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.6 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3368  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.52 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  0.793751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.51 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.65 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0712  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  46.3 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0920845  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.71 
 
 		 187 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0267  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.86 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4573  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.41 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0828  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.41 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  43.43 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0556  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.82 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.77 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0844  ATP synthase subunit B', membrane-bound, F0 sector  46.41 
 
 		 186 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0514  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.32 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0236  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.86 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0931  ATP synthase  43.83 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4814  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  44.13 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653502  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2592  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.16 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2877  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.76 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.16 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1036  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.94 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2697  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.94 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0607065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3244  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.29 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0192  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.94 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.41 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3028  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.98 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.873378  normal  0.282628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2203  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.16 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4379  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.76 
 
 		 199 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4485  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.21 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1891  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.41 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0874  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.3 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1078  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.89 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1088  ATP synthase F0, B' subunit  31.76 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.96 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.43 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.67 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.67 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  29.13 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.27 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  28.09 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0398  ATP synthase F0, B' chain  25 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.57 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  32.05 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  29.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.39 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.08 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  22.9 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.72 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  21.28 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  24.82 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.88 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 		 184 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 156 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 156 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  29.49 
 
 		 156 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.84 
 
 		 156 aa  42  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.39 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  26.43 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>