91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1035 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1035  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 187 aa  359  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.407381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2696  F0F1 ATP synthase subunit B  98.91 
 
 		 184 aa  350  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.987968  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0193  F0F1 ATP synthase subunit B  92.93 
 
 		 184 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  59.24 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2591  F0F1 ATP synthase subunit B  62.36 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3027  F0F1 ATP synthase subunit B  58.06 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.281762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0770  F0F1 ATP synthase subunit B  57.89 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0397  F0F1 ATP synthase subunit B  42.41 
 
 		 159 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0385  F0F1 ATP synthase subunit B  42.41 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0503  F0F1 ATP synthase subunit B  40.51 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0337888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0699  F0F1 ATP synthase subunit B  42.41 
 
 		 159 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3243  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.38 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0694  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.5 
 
 		 161 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0934  F0F1 ATP synthase subunit B  36.71 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0379  F0F1 ATP synthase subunit B  32.9 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1976  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.69 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4813  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.12 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.562728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0450  F0F1 ATP synthase subunit B  35.44 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292489  normal  0.116095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0740  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.97 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0843  ATP synthase subunit B, membrane-bound, F0 sector  38.71 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0515  F0F1 ATP synthase subunit B  39.24 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.354645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1079  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.67 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1319  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.07 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0557  F0F1 ATP synthase subunit B  39.07 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.91 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.51 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0235  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.28 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4486  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  42.62 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2204  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.56 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.197491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3367  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.81 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223536  normal  0.761961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3496  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.25 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3172  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.62 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0266  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.51 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.6 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6947  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.65 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0143098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.26 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6946  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.74 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4380  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7659  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.41 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0943921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7660  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.44 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0882043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.53 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.36 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3676  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  28.02 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0502  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.01 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  26.49 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0384  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0396  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.71 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0711  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.18 
 
 		 162 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0198649  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3819  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.98 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0269692 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.31 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0378  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.12 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 		 161 aa  47.8  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  37.63 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  27.38 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.95 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  28.21 
 
 		 448 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0394  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.38 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.861727  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0449  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.37 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1977  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.77 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0985577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.32 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3336  ATP synthase F0 subunit B  29.79 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  28.03 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0698  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.87 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  24.18 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0769  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.87 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.842135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0336  bifunctional acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha/beta  40 
 
 		 735 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0741  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.97 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.513866 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.84 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.79 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  25.28 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0695  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.32 
 
 		 187 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0599  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.95 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000443897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.18 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>