69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1251 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 170 aa  336  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  52.08 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  48.28 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  48.28 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  48.28 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  47.55 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  45.83 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  39.33 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.03 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  37.76 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.13 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.54 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  25.45 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  30.14 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.3 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  37.86 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.57 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  25.93 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  25.97 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.97 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.05 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  30.82 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.86 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  31.68 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  28.47 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.91 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.91 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  27.33 
 
 		 184 aa  50.8  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  28.99 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.78 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.54 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.62 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.72 
 
 		 448 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  29.38 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.5 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  30.91 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  27.08 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  24.43 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.76 
 
 		 445 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 		 156 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.19 
 
 		 443 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  32.09 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.19 
 
 		 443 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.19 
 
 		 443 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>