273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0294 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
161 aa  298  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  55.28 
 
 
161 aa  160  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  45.28 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  45.28 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  33.54 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.78 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  37.06 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.34 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  32.26 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  34.53 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  34.04 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.53 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  31.43 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  33.09 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  32.39 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.11 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  32.37 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  32.31 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.97 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  29.05 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  30.95 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  35.76 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  29.11 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  29.11 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4110  ATP synthase F0, subunit B  30 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255147  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.87 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  30.32 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.48 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  33.58 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  28.37 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 
146 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.43 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  28.76 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
184 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
203 aa  62  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  27.45 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 
146 aa  61.6  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  35.78 
 
 
245 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.45 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.77 
 
 
167 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  28.33 
 
 
264 aa  60.8  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 
156 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  60.5  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  28.39 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>