28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1734 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1734  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
169 aa  328  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  75.88 
 
 
170 aa  254  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1529  F0F1 ATP synthase subunit B  51.74 
 
 
172 aa  174  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  45.12 
 
 
170 aa  145  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  45.73 
 
 
170 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  46.5 
 
 
170 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  41.72 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  46.34 
 
 
170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  33.53 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.25 
 
 
193 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  22.95 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  27 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  30.36 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  30.36 
 
 
164 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.37 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  27.37 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  23.53 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  23.39 
 
 
264 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.89 
 
 
172 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1890  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.27 
 
 
164 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0247622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  24.21 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.04 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>