94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0944 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3136  F0F1-type ATP synthase, subunit B  100 
 
 		 141 aa  261  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  100 
 
 		 141 aa  261  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.66 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.66 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.79 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  24.11 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.71 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  31.21 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.37 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.5 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  35.14 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  26.4 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.54 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  26.09 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.62 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.17 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  26.03 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.74 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.45 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  37.37 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  27.56 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.24 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.78 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.53 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  25 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.29 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  21.74 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  25.76 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.59 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  25 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4258  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.68 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000634624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.73 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.73 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.48 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  26.53 
 
 		 413 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  28.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  32.23 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.97 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  25.37 
 
 		 264 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  32.38 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.93 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.91 
 
 		 161 aa  42.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  25.74 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  22.22 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.55 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.08 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  25.93 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.02 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.35 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  23.91 
 
 		 164 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.73 
 
 		 163 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.61 
 
 		 270 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  23.91 
 
 		 164 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  41.18 
 
 		 255 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  27.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  25.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.72 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.99 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  23.97 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.24 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  26.24 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  34.55 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  27.06 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  25.62 
 
 		 192 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 		 156 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  27.07 
 
 		 156 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>