133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0984 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  99.35 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15731  F0F1 ATP synthase subunit B'  81.7 
 
 		 153 aa  223  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.723597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04801  F0F1 ATP synthase subunit B'  74.51 
 
 		 151 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  59.48 
 
 		 153 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.82 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.82 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  58.82 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2191  F0F1 ATP synthase subunit B'  62.5 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0485  F0F1 ATP synthase subunit B'  61.11 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.383188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  38.46 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.34 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  42.34 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.06 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.26 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.68 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.33 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  35.16 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.58 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3335  H+transporting two-sector ATPase subunit B/B'  37.68 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.843429  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  28.17 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  29.13 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.23 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  23.84 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.39 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  29.53 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  29.23 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  25.74 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  27.21 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  28.23 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0079  ATP synthase F0, B subunit  32.58 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.12 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  27.54 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0395  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.38 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.56 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  30.37 
 
 		 245 aa  48.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  30.16 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.8 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  24.39 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  23.57 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  28.83 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.01 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  30.08 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  23.53 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  30.3 
 
 		 525 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.09 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.87 
 
 		 259 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.21 
 
 		 194 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.29 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  24.26 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  22.79 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  26.81 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 525 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>