38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0510 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
140 aa  276  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.71 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.29 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  40 
 
 
140 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  45 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  37.78 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.96 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.33 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.06 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.06 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  34.29 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  32.81 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.74 
 
 
181 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.12 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.91 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.31 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13609  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  26.5 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.68 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  34.69 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  27.19 
 
 
264 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.47 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
175 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  27.05 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  27.05 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.03 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0368  F0F1 ATP synthase subunit B  33.8 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.685642  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
179 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  22.92 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.72 
 
 
168 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.83 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.83 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  27.34 
 
 
156 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>