83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2778 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  47.52 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  48.15 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  46.41 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  45.87 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  49.38 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  49.59 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  48.97 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  48.97 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  48.97 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  48.97 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  48.97 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.21 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  42.91 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  35.42 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  27.06 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  28.25 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.77 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  30.84 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.21 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.28 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.26 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 166 aa  72  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.67 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.16 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.16 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.13 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  24.78 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  37.14 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  40.21 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  26.74 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.09 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  31.36 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.86 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.61 
 
 		 167 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  32.65 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.08 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.08 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  24.9 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.22 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.05 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.36 
 
 		 171 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 172 aa  52  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.58 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.86 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.08 
 
 		 164 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  30.15 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  28.65 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  27.88 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  29.31 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  26.32 
 
 		 167 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  34.31 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  34.95 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.95 
 
 		 164 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.07 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.82 
 
 		 153 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  29.09 
 
 		 157 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.58 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.06 
 
 		 153 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.35 
 
 		 177 aa  45.4  0.0009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.87 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.27 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.6 
 
 		 141 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.87 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  33.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  30.54 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  27.27 
 
 		 175 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  20.42 
 
 		 181 aa  42.4  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.13 
 
 		 140 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 		 156 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  26.77 
 
 		 203 aa  42  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>