47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0044 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  100 
 
 		 248 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  49.59 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.6 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  48.37 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  53.01 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  55.28 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  55.69 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  55.69 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  55.69 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  55.69 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  55.69 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.01 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.54 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  33.07 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  29.52 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.42 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.04 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.73 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.33 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  25.11 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  27.27 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.19 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.29 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.89 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  33.01 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  26.51 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  29.45 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.39 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  40 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  23.26 
 
 		 167 aa  49.7  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25.3 
 
 		 164 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.52 
 
 		 166 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  30.32 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.9 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  33.65 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.77 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  23.57 
 
 		 161 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 		 178 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  21.96 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.88 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  32.04 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.38 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  30.36 
 
 		 156 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.85 
 
 		 186 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>