65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2646 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 		 249 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  99.2 
 
 		 249 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  92.77 
 
 		 249 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  48.97 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  51.01 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  52.61 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  46.94 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.84 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  54.69 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.27 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  39.11 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  29.13 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  25.1 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  37.3 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.89 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  30.2 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.52 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.44 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.64 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.56 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.4 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  27.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  27.08 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  24.17 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 		 162 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  28.17 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  34.19 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.47 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  56.41 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.62 
 
 		 171 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  34.03 
 
 		 141 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  31.16 
 
 		 172 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  20.56 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  29.58 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  31.91 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  24.5 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.4 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  28.8 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.64 
 
 		 168 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  23.12 
 
 		 167 aa  46.2  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 141 aa  45.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.99 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  23.58 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 443 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25.37 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  31.88 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.91 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.24 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2586  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.45 
 
 		 203 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  33.53 
 
 		 179 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>