56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1434 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.42 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.2 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  32.79 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  35.12 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  29.83 
 
 		 413 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.74 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  38.84 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.15 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1123  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.76 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.74 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  26.98 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.89 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  30.42 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  29.48 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  29.91 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  24.8 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  26.42 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  56.1 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0044  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.98 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  24.78 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  30 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.08 
 
 		 161 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0129  ATP synthase F0, B subunit  38.02 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1296  ATP synthase F0, B subunit  38.02 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2646  putative ATP synthase F0, B subunit  38.02 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0153  ATP synthase F0, B subunit  38.02 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1049  ATP synthase F0, B subunit  38.02 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  25.96 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.67 
 
 		 164 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  27.1 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.61 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2191  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  24.16 
 
 		 188 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 		 164 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  23.13 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.09 
 
 		 164 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2827  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.09 
 
 		 189 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.88 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.37 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.35 
 
 		 189 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  27.67 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.76 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  23.9 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.77 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.69 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.39 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 164 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.27 
 
 		 171 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 		 179 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  32.35 
 
 		 163 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  23.19 
 
 		 164 aa  42  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>