126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0441 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
255 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.95 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  34.11 
 
 
302 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  36.36 
 
 
326 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  31.27 
 
 
278 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  36.29 
 
 
278 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  34.25 
 
 
253 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  29.46 
 
 
413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  34.5 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.46 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.2 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  33.33 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  33.33 
 
 
264 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  26.81 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  32.58 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.21 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.22 
 
 
162 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  35.63 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  24.11 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  31.98 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  34.29 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  38.04 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.02 
 
 
141 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
161 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 
156 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.42 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.6 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  39.13 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.82 
 
 
163 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  36.27 
 
 
238 aa  55.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.11 
 
 
156 aa  55.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
163 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
164 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.91 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  30.16 
 
 
178 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.7 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
156 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  28.67 
 
 
156 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  28.82 
 
 
167 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  35.53 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.33 
 
 
138 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7012  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.3 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303769  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4102  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.3 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0000508858  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  31.94 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  45 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  28.47 
 
 
156 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  34.38 
 
 
141 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  30.88 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
164 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 
165 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  26.19 
 
 
164 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
161 aa  48.5  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  26.19 
 
 
164 aa  48.9  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.96 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3362  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.67 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.126786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.62 
 
 
139 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  27.01 
 
 
164 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  29.25 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
165 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  32.38 
 
 
172 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.75 
 
 
171 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  28.89 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.94 
 
 
168 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  31.62 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  31.63 
 
 
168 aa  45.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  31.9 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  28.15 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  27.59 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  42.5 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>