151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0894 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  100 
 
 
253 aa  508  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.8 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  42.97 
 
 
413 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  45.2 
 
 
278 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  44.84 
 
 
264 aa  197  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  41.57 
 
 
278 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  43.43 
 
 
271 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  38.46 
 
 
291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.15 
 
 
270 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  34.5 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  31.68 
 
 
302 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  32.39 
 
 
255 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  29.69 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.79 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  24.11 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.03 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.14 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  39.58 
 
 
166 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  44.07 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  30.33 
 
 
156 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  28.81 
 
 
156 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.79 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.69 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  32.56 
 
 
156 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  27.05 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.47 
 
 
181 aa  53.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  28.69 
 
 
156 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  41.84 
 
 
159 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  41.84 
 
 
159 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.22 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  33.08 
 
 
156 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  33.87 
 
 
156 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
156 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  52  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  40.38 
 
 
163 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  35.54 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  33.87 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.89 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  27.05 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  40.38 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  32.48 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03109  F0F1 ATP synthase subunit B  31.71 
 
 
156 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25.49 
 
 
177 aa  50.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  37.97 
 
 
156 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  37.65 
 
 
156 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  37.65 
 
 
156 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
156 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.37 
 
 
151 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  26.34 
 
 
245 aa  49.3  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  30.33 
 
 
156 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 
156 aa  48.9  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 
156 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  33.68 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.08 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  26.27 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  26.89 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
168 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  37.93 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.05 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  29.01 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  29.32 
 
 
162 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  25.42 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0306  F0F1 ATP synthase subunit B  27.87 
 
 
156 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000623248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.68 
 
 
156 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.68 
 
 
156 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  31.75 
 
 
156 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0211  F0F1 ATP synthase subunit B  52.78 
 
 
157 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.04 
 
 
178 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  24.58 
 
 
156 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  38.46 
 
 
164 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  28.68 
 
 
156 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.3 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>