More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2077 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
201 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.22 
 
 
186 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  61.58 
 
 
186 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  60 
 
 
186 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.56 
 
 
186 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  60 
 
 
186 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.44 
 
 
186 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.89 
 
 
186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  60 
 
 
188 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  60 
 
 
188 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  58.56 
 
 
194 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.22 
 
 
180 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.3 
 
 
188 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.11 
 
 
186 aa  195  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.11 
 
 
186 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  56.35 
 
 
190 aa  193  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.11 
 
 
186 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.62 
 
 
193 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  53.8 
 
 
190 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  54.14 
 
 
190 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  54.05 
 
 
189 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  56.83 
 
 
188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  51.89 
 
 
189 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  53.07 
 
 
179 aa  178  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  57.38 
 
 
190 aa  177  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  48.89 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  48.89 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.63 
 
 
186 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.02 
 
 
190 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  43.33 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  48.89 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  43.89 
 
 
217 aa  152  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.59 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  42.78 
 
 
186 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  42.22 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  41.76 
 
 
196 aa  124  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  41.48 
 
 
197 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  36.57 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.83 
 
 
180 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  35.96 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  39.77 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  42.2 
 
 
179 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
180 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.2 
 
 
179 aa  104  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
184 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
176 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
180 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.11 
 
 
182 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  33.33 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
179 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
178 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  26.26 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  28.33 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
178 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  27.38 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  26.04 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  30 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>