108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0990 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  100 
 
 		 138 aa  269  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  58.7 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  57.25 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.1 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3361  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  43.8 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153256  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.5 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  32.87 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  28.24 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.88 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.88 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.43 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  28.26 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  27.07 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.25 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  24.81 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.36 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.72 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  26.52 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.87 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1489  F0F1 ATP synthase subunit B'  29.29 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  24.43 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.81 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  27.66 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.48 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  24.81 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.32 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  26.72 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.26 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.37 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  26.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  28.67 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  24.24 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  24.24 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  24.24 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  24.06 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 194 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  32.14 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  24.64 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  31.43 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  21.54 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.74 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  22.9 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  26.47 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  26.47 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.61 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4040  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.78 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0312364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  33.87 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  25.38 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  27.48 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  29.37 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.71 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  24.43 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  29.79 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  29.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3955  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  33.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.138638  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3411  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.78 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00705925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  27.7 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  22.79 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  25.19 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 		 156 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 		 156 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  23.19 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.17 
 
 		 182 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  28.78 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000261662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  28.99 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.08 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  23.7 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  21.97 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  29.71 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  31.47 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  21.17 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0944  putative F0F1-type ATP synthase  31.21 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.360039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>