27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1733 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
140 aa  265  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  80.71 
 
 
140 aa  218  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  55 
 
 
140 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.71 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  42.14 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.39 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  45.39 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.14 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  44.68 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.86 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.36 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  34.52 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.46 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  26.61 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  32.95 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  26.61 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.19 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.19 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  33.65 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  27.13 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.33 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.92 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.79 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  26.56 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>