60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2070 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  100 
 
 
277 aa  544  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  69.42 
 
 
245 aa  341  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  69.83 
 
 
245 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  69.01 
 
 
245 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  69.01 
 
 
245 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  69.01 
 
 
245 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  69.39 
 
 
263 aa  335  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  69.42 
 
 
245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  56 
 
 
250 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  58.23 
 
 
238 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  57.02 
 
 
229 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  36.17 
 
 
229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  27.67 
 
 
162 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  32 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  33.11 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  32.68 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  29.38 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  41.28 
 
 
162 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  34.78 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  23.6 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  37.74 
 
 
177 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  24.38 
 
 
222 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  34.41 
 
 
310 aa  62  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  35.21 
 
 
186 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  33.91 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  29.88 
 
 
175 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  23.14 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  23.14 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  41.23 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  31.19 
 
 
170 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  30.97 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  33.76 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  42.25 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  40 
 
 
304 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  32.62 
 
 
684 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  23.08 
 
 
152 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  27.88 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  27.16 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  33.68 
 
 
168 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1374  ATPase subunit H  30.59 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
200 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  26.28 
 
 
139 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4574  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.89 
 
 
163 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  29.05 
 
 
385 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  26.96 
 
 
170 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  20 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  34.43 
 
 
510 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0634  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  25.44 
 
 
152 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  26.56 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  26.01 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  33.33 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  28.45 
 
 
179 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0827  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  39.19 
 
 
163 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  58.54 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  38.03 
 
 
452 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2990  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000214973  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0911  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  39.19 
 
 
163 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  25.47 
 
 
152 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>