176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0879 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
185 aa  363  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  30.94 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.95 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  27.74 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.85 
 
 
173 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.68 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.15 
 
 
164 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  27.86 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  30.94 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  25.74 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  25.74 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.27 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  28.86 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  26.03 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  28.08 
 
 
164 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  25.76 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  28.17 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.14 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  25.55 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.92 
 
 
163 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  26.57 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  26.67 
 
 
156 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  24.03 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  26.92 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  26.62 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4190  F0F1 ATP synthase subunit B  27.01 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000644927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.72 
 
 
165 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.72 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 
156 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  26.15 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  29.71 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.6 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  28.87 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.83 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  26.72 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4253  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0299011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  29.85 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  25.95 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  24.44 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.12 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  30.37 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  28.79 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  25.66 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.3 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  29.1 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0145  ATP synthase F0, B subunit  23.08 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  hitchhiker  0.00203214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  27.41 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  28.33 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  24.29 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  27.41 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  25.37 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  26.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  24.09 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>