More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1223 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.49 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.93 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.96 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.22 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  53.98 
 
 		 194 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.39 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  48.02 
 
 		 217 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.31 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.77 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.6 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.85 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.85 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.31 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  46.63 
 
 		 201 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.77 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.31 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  47.43 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.24 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  42.47 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.81 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  39.78 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  39.78 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  41.57 
 
 		 194 aa  137  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  38.71 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  42.05 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  40.91 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  40.34 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  43.89 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.03 
 
 		 184 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  39.89 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  42.53 
 
 		 190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  40.32 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  41.48 
 
 		 198 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  42.05 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  42.55 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  40.8 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  43.53 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  41.48 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.73 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 		 180 aa  90.9  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 182 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.35 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.33 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  30.22 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  30.23 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  30.9 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  29.61 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.53 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.13 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.13 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  34.27 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.69 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  26.92 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>