202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 
271 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  36.96 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  35.69 
 
 
271 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  34.93 
 
 
274 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.81 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  35.16 
 
 
269 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  38.15 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  35.02 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  37.36 
 
 
270 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  36.09 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.34 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  36.44 
 
 
274 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  36.13 
 
 
276 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  35.63 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  37.34 
 
 
274 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.59 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.22 
 
 
271 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  33.58 
 
 
449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  35.77 
 
 
290 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
278 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.62 
 
 
274 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  31.97 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  31 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.42 
 
 
276 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  35.15 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
445 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.59 
 
 
445 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  36.96 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
443 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
443 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
443 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.68 
 
 
446 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  31.39 
 
 
275 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  30.17 
 
 
273 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  29.29 
 
 
448 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.58 
 
 
279 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  32.47 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.04 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.83 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  25.61 
 
 
186 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
180 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 
180 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  28.19 
 
 
180 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 
179 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.64 
 
 
179 aa  62.4  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  38.55 
 
 
179 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.35 
 
 
182 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 
179 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  26.34 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.06 
 
 
188 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.42 
 
 
182 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
182 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.81 
 
 
178 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
179 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.58 
 
 
180 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.16 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  26.38 
 
 
177 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.81 
 
 
178 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.3 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
188 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  24.67 
 
 
193 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  41.67 
 
 
197 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
177 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
178 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.58 
 
 
182 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.62 
 
 
177 aa  55.8  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.51 
 
 
186 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.34 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.34 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
179 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.68 
 
 
179 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.11 
 
 
180 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  33.68 
 
 
135 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  27.11 
 
 
194 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 
186 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
186 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  22.78 
 
 
188 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.64 
 
 
180 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 
188 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
180 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.23 
 
 
179 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  26.67 
 
 
190 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.23 
 
 
180 aa  52.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.23 
 
 
180 aa  52.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
186 aa  52.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 
180 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  38.81 
 
 
186 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.21 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>