More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6065 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 179 aa  352  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 		 180 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.85 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.11 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.68 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.24 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.87 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.44 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.66 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 		 180 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  32.96 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.05 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.99 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.21 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  38.41 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.67 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  30.64 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 		 186 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  32.18 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.98 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  37.36 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 		 186 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  32.75 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  29.65 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 		 178 aa  90.9  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  32.76 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  30.39 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.42 
 
 		 182 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  34.48 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  26.74 
 
 		 205 aa  87.8  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  29.83 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.38 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 		 180 aa  84  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  33.33 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  33.15 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.91 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  24.14 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>