More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2828 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  76.5 
 
 
183 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  69.4 
 
 
183 aa  249  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.52 
 
 
184 aa  202  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.83 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  37.99 
 
 
179 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
180 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
180 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  118  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
180 aa  117  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 
182 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
183 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
188 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  101  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
181 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  35.43 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  37.28 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
176 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
182 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  35.33 
 
 
184 aa  91.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
201 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.92 
 
 
180 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
178 aa  87.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  32.24 
 
 
182 aa  87  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.52 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  32.76 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.26 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  31.98 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  30.29 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  32.34 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  29.82 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  26.55 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  28.89 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  27.53 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  31.82 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  27.62 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>