More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2185 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
183 aa  353  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.38 
 
 
183 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.74 
 
 
183 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.83 
 
 
183 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.37 
 
 
184 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.69 
 
 
179 aa  149  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.7 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.97 
 
 
180 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  35.06 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.52 
 
 
180 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.52 
 
 
180 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
180 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 
182 aa  104  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.69 
 
 
180 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
180 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
179 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.66 
 
 
179 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.69 
 
 
180 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  39.66 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.25 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.67 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.25 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.96 
 
 
178 aa  94.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  32.42 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  31.15 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
183 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.97 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 
179 aa  84.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.96 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  30.73 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.33 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  31.28 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  31.15 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.61 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.87 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.25 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  31.49 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.49 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  30.54 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  26.23 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  30.11 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  29.76 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  33.7 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  29.61 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  24.86 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>