More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2706 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
181 aa  361  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  69.06 
 
 
181 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.36 
 
 
178 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.22 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.37 
 
 
179 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.84 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.6 
 
 
180 aa  181  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  38.89 
 
 
192 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.85 
 
 
180 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
180 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
180 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
184 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
181 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
178 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.98 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
188 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
179 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  32.35 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  32.02 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
178 aa  97.4  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 
179 aa  94  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  32.39 
 
 
177 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  31.67 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
194 aa  91.3  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
179 aa  89  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.09 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.23 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.15 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  28.24 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.76 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  30.46 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.01 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.34 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.65 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.34 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28.16 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>