275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0340 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  57.45 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.72 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.85 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.72 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.19 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  56.83 
 
 		 201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.66 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.13 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.19 
 
 		 186 aa  177  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.75 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  51.38 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  50.28 
 
 		 190 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  49.17 
 
 		 189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  51.4 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.47 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.47 
 
 		 188 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  49.16 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  48.6 
 
 		 190 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  50 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.51 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.21 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.68 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.15 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.68 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  41.49 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  41.49 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.55 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.55 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  41.49 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  39.34 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  39.89 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  36.51 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  38.22 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.09 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  37.02 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  38.12 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  37.14 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 		 181 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  32.07 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 		 182 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.89 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  32.34 
 
 		 176 aa  87.8  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 		 180 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  30.56 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.11 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.37 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  32.09 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  26.7 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  24.39 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  28.66 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>