204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0182 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  41.28 
 
 
179 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  40.66 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  41.04 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  38.89 
 
 
186 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  37.93 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  32.77 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.67 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.92 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  33.7 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.12 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  28.49 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  30.63 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.32 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  26.7 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  27.01 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.62 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  24.29 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  28.88 
 
 
217 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.12 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.6 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  29.59 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.22 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.6 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  27.75 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  24.43 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  24.14 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
186 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  21.84 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  25.42 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  24.86 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1977  ATP synthase F1, delta subunit  25.31 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.27166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>