293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1504 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.78 
 
 
180 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.89 
 
 
180 aa  161  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.33 
 
 
180 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.56 
 
 
180 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.22 
 
 
180 aa  151  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.64 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
179 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
183 aa  111  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
184 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
193 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
183 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
183 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
182 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.52 
 
 
183 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
183 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30.56 
 
 
179 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
182 aa  100  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 
179 aa  100  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  36.31 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30 
 
 
182 aa  97.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  37.2 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
190 aa  89  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.67 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  26.82 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  26.97 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  26.55 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  29.28 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  25.41 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  26.26 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.25 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>