More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2605 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  37.93 
 
 
175 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 
179 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
180 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
181 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
180 aa  99  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  34.46 
 
 
182 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.67 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.7 
 
 
182 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.57 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.16 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.97 
 
 
180 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.48 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
180 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.73 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.36 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.1 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 
180 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
181 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
182 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28.65 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  29.44 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  28.12 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  25.58 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.46 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0149  ATP synthase F1, delta subunit  27.61 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  24.39 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>