281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1058 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  50.28 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  41.81 
 
 
182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 
186 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  34.43 
 
 
182 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.22 
 
 
192 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.72 
 
 
179 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  32.22 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  32.77 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
181 aa  92  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  25.42 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  32.02 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
181 aa  87.4  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  25.6 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
180 aa  84.3  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
178 aa  84  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.53 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.16 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  28.95 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  32.02 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.33 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.76 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
183 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.84 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.35 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  25.9 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  24.39 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  26.44 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  26.19 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  26.19 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.69 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  25.14 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  25.75 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  27.38 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>