292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2189 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  362  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  83.52 
 
 
182 aa  307  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.19 
 
 
182 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.34 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.34 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.14 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
180 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
180 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
180 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.22 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.29 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.29 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  37.8 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 
186 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.2 
 
 
180 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
185 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  34.05 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  32.97 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  32.24 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
188 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.93 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  31.15 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.09 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  30.05 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.93 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  31.43 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.67 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  27.71 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  27.78 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  29.12 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  28.65 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  32.22 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  28.24 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  23.7 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  28.92 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  29.19 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.18 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  23.56 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  26.19 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.88 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.33 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0656  ATP synthase F1, delta subunit  26.9 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0940126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  29.44 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>