More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3655 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  98.94 
 
 
188 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  77.66 
 
 
188 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  72.54 
 
 
193 aa  276  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  72.04 
 
 
186 aa  266  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  71.51 
 
 
186 aa  264  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  71.51 
 
 
186 aa  263  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  70 
 
 
180 aa  245  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  57.84 
 
 
194 aa  208  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.55 
 
 
186 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  60 
 
 
201 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.3 
 
 
186 aa  204  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.32 
 
 
186 aa  201  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.18 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.62 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.18 
 
 
186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.62 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.93 
 
 
186 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  52.57 
 
 
190 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  50.86 
 
 
190 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  49.44 
 
 
189 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  48.31 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  48.3 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  48.35 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  50.28 
 
 
194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.33 
 
 
190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  44.09 
 
 
186 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  44.09 
 
 
186 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  49.47 
 
 
188 aa  160  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  43.55 
 
 
217 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  46.52 
 
 
190 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  41.4 
 
 
186 aa  155  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.82 
 
 
184 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  40.86 
 
 
186 aa  151  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  47.54 
 
 
196 aa  150  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  44.62 
 
 
186 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  40.96 
 
 
211 aa  137  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  41.01 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  35.8 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  36 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
180 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  35.43 
 
 
179 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.31 
 
 
182 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.64 
 
 
182 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
180 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
180 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
182 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
193 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
179 aa  97.8  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
180 aa  91.7  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
183 aa  89  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
183 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  30.56 
 
 
227 aa  86.3  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
176 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.83 
 
 
182 aa  85.1  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  34.64 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
177 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  28.49 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  29.71 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  30.95 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.82 
 
 
192 aa  79  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.81 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  33.89 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  30.81 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>