288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0535 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  92.78 
 
 
180 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  92.22 
 
 
180 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  39.41 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  34.46 
 
 
182 aa  110  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 
177 aa  95.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
182 aa  89  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
183 aa  87.4  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.49 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.61 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.29 
 
 
178 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  32.3 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  31.9 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  31.11 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.06 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  32.54 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  29.38 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.12 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  27.61 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.98 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  27.59 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  29.52 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  29.27 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.29 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.56 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.92 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  28.48 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>