More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2585 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.78 
 
 
183 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.11 
 
 
180 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 
180 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.33 
 
 
184 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  36.05 
 
 
179 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.21 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.42 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 
179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
179 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.96 
 
 
182 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
182 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
180 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
180 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
183 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35.12 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  32 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
179 aa  94  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
184 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.88 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 
186 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  32.04 
 
 
179 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  29.67 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
275 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  29.67 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.79 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  24.86 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.76 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  24.28 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>