More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3363 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
184 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.98 
 
 
183 aa  210  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.63 
 
 
183 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.52 
 
 
183 aa  184  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.11 
 
 
179 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.37 
 
 
183 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.61 
 
 
180 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.07 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.07 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.52 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.88 
 
 
180 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.24 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.33 
 
 
183 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.97 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
179 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.67 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
180 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.6 
 
 
180 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
179 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
179 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
193 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
181 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
201 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
179 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
192 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.15 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.47 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.05 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  32.39 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.43 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
181 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.39 
 
 
186 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.22 
 
 
182 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
190 aa  92  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
186 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.71 
 
 
176 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.28 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
186 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.46 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30.27 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  31.55 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  34.12 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
217 aa  81.3  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.57 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  30.77 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  26.7 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  26.7 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  32.22 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  40.2 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>