More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0335 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  356  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
185 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.72 
 
 
185 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.43 
 
 
184 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.4 
 
 
182 aa  164  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.4 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.35 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  50.93 
 
 
184 aa  160  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.65 
 
 
182 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.88 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.47 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.47 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  33.93 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
182 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.71 
 
 
180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.47 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.2 
 
 
182 aa  111  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.42 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.79 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.79 
 
 
180 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.41 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
179 aa  104  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
178 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.8 
 
 
180 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 
180 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  32.18 
 
 
182 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.5 
 
 
178 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.68 
 
 
180 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
182 aa  101  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
180 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  35 
 
 
192 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.92 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.04 
 
 
179 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.55 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.09 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.5 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.1 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.69 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  33.54 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  34.64 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.93 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
176 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.72 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  31.95 
 
 
217 aa  87.8  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
194 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  32.22 
 
 
178 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.97 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  33.92 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  30.36 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.48 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  30.56 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.43 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.52 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  35 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.54 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.12 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.12 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  28.14 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.36 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.72 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.59 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>