More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1545 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  348  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  95.56 
 
 
180 aa  337  8e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  94.44 
 
 
180 aa  330  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  90 
 
 
180 aa  323  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.67 
 
 
182 aa  207  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  55 
 
 
182 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.11 
 
 
182 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
182 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
182 aa  184  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.04 
 
 
184 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.88 
 
 
183 aa  123  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  41.46 
 
 
184 aa  120  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  34.08 
 
 
179 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
182 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
180 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.93 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.73 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
190 aa  89  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
178 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
180 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.54 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.53 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.92 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  25.73 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  29.89 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.89 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  31.79 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0144  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.000353318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.73 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  29.82 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  28.14 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  27.98 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.59 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0656  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0940126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  33.54 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.28 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0518  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  30.43 
 
 
273 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  28.33 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  28.09 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  25.6 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  28.09 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>