More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0487 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  358  2e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  83.52 
 
 
182 aa  307  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.19 
 
 
182 aa  229  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.44 
 
 
182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.44 
 
 
182 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.14 
 
 
182 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
180 aa  191  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
180 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.22 
 
 
180 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
185 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
185 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  37.2 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.64 
 
 
180 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
185 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.53 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  33.15 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  31.49 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.7 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  31.84 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  31.28 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.67 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.22 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  23.12 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  28.89 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  30.46 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  31.76 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  26.35 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  24.72 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.51 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  32.58 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.35 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  21.84 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  31.08 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
275 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>