More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0982 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
182 aa  360  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  99.45 
 
 
182 aa  360  6e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  78.57 
 
 
182 aa  298  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  74.18 
 
 
182 aa  283  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  60.44 
 
 
182 aa  224  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.34 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.67 
 
 
180 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  55 
 
 
180 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
182 aa  127  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.15 
 
 
183 aa  121  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
185 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 
185 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  36.59 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.97 
 
 
185 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.47 
 
 
180 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.51 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
182 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  30.36 
 
 
182 aa  84.3  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  29.89 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  25.88 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  24 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.65 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  27.71 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  27.12 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.28 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.09 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  23.08 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.26 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.48 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.26 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  26.19 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  29.73 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1712  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.8 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.3 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  26.22 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  24.12 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  24.57 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  25 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  28.48 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  28.76 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.35 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  25.84 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  25.28 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.15 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28.74 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  27.43 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.29 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.29 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.57 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.61 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  26.11 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>