291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2180 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1712  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.69 
 
 
179 aa  224  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  27.12 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  26.01 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.07 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  30.81 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  28.16 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.75 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  26.59 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  27.06 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  23.84 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.73 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.43 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  28 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.12 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  23.35 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  23.03 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.67 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  27.06 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  25.14 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  25.28 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  28.09 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  23.03 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  28.26 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  22.99 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.29 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  22.78 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.73 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  26.22 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  21.91 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>