278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1712 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1712  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  64.8 
 
 
179 aa  241  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  64.8 
 
 
179 aa  241  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  28.98 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.56 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  23.56 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  24.72 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.07 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.56 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  27.22 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.44 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  27.93 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.69 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  25.44 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  24 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  28.9 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.58 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.76 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
186 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.44 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
188 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.4 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  29.83 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  24.7 
 
 
192 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  25.43 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.82 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  25 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  24.86 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  22.81 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  22.81 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.03 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
177 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
188 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  26.55 
 
 
179 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  22.16 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.72 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.72 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  29.48 
 
 
209 aa  61.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  25.99 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  26.09 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.26 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.73 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  24.56 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>